Trojan Remover révélera toute son efficacité quand il s'agira de supprimer les chevaux de troie et vers que n'aurait pas détecté un anti-virus standard. Reconaissant plus de 15000 virus, Trojan Remover a été écrit pour effectuer des suppressions sans que l'utilisateur ait à éditer manuellement le registre. Il scanne le système, y compris le registre Windows, et trouvera les Trojans qui sont chargés lors du démarrage du système (la plupart des Trojans s'activent ainsi).